Budowę nowego kościoła planowano zaraz po utworzeniu lokali jednakże II wojna światowa przerwała owe plany. Cały czas jednak gromadzono fundusze na budowę. Tuż po wojnie, 30 września 1947 powołano Komitet Budowy Kościoła i oficjalnie rozpoczęto budowę przy której pomagała większość parafian. Świątynia powstał jedynie dzięki religijnej postawie parafian, dużej roli społecznej Kościoła na Górnym Śląsku oraz energicznym i konsekwentnym działaniom ks. proboszcza T.Gałązki zdołano wznieść świątynię w zredukowanej do pierwotnych projektów formie.
W styczniu 1948 przywłaszczono pierwsze grunty, a w sierpniu wydzierżawiono teren pod budowę kościoła od Rudzkiego ZPW. Ostatecznie 30 września 1948 zakupiono teren pod budowę kościoła. 18 maj 1948 przerzucono pierwszą skibę ziemi pod budowę probostwa, budowę probostwa zlecono 7 sierpnia budowniczemu Bujarze z Pyskowic. Pierwszy odpust w nowym kościele obchodzono 22 maja 1949, a pół roku wcześniej (27.11.1948) utworzono chór kościelny. Dzięki ofiarnej pracy wielu parafian udało się już po niecałych dwóch latach oddać część budynku kościoła.
Już 2 października 1949 poświęcono kamień węgielny i część nowego kościoła - prezbiterium z kryptą i poprzeczną nawą. Aktu poświęcenia dokonał bp J. Bieniek. Projektantem kościoła był Romuald Holeczek, konstruktorem i kierownikiem budowy był inż A. Galat z Politechniki Śląskiej . Dalsza budowa świątyni została wstrzymana. W styczniu 1950 roku odprawiono dwie ostatnie msze święte w kaplicy na rogu ulicy Bielszowickiej i 1 Maja. Od 1951 roku prezbiterium wireckiej świątyni zdobią witraże .
Witraże zostały wykonane według projektu Adama Bunscha - ucznia Józefa Mahoffera i Rogi Skąpsklej. Wykonane w krakowskiej pracowni witrażowej S.G. Żeleńskich (w dolnej partii lewego witraża, przedstawiająca męczeńską śmierć Andrzeja Boboli znajduje się sygnatura artysty oraz Zakładu Braci Żeleńskich) , trzy witraże przedstawiają życie św. Andrzeja Boboli, a witraże w bocznych aneksach - zakrystii i kaplicy przedstawiają św. Annę Samotrzecią oraz św. Maksymiliana Kolbego tworząc razem przemyślaną i całościowo opracowaną koncepcję. Dekretem ks. Bp. Stanisława Adamskiego z dnia 28 maja 1957 orzekł kurację jako parafię nieusuwalną. Kościół został poważnie uszkodzony w latach 1956-1958 wskutek eksploatacji górniczej i został wyłączony z użytku. 7 października 1959 przeniesiono Najświętszy Sakrament do krypty dolnej gdzie do grudnia 1962 odprawiano nabożeństwa.